Reconstruction probabiliste de généalogies dans les populations végétales polyploïdes

On proposera dans cet exposé une approche probabiliste de reconstruction de généalogies dans les populations végétales polyploïdes de 2x à 4x (c'est-à-dire que les chromosomes des individus vont soit par paires, soit par triplets, soit par quadruplets). Dans un tel modèle, les lois de reproduction sont soumises à des règles combinatoires et à la problématique du dosage allélique (par exemple un hétérozygote 4x peut donner lieu à de nombreux génotypes : 'aaab', 'aabb', 'abbb', 'aabc', 'abbc', ..., 'abcd'). Notre modèle tient compte de ces phénomènes et propose une arborescence probabilisée des liens génétiques potentiels dans la population. Nous l'observerons en simulation et sur données réelles. Comme thème d'ouverture et problématique de recherche, nous discuterons de l'équilibre de de Hardy-Weinberg qui devrait, à terme, nous permettre d'affiner le dosage allélique.